化学经纬
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成药性相关小知识(1):亲脂性——logP、logD

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一、亲脂性

  • 化合物的亲脂性通常用辛醇/水的分配 LogP来估算。

  • 亲脂性是许多 ADME/Tox性质的主要决定因素之一。

亲脂性是一种能对化合物的吸收、分布、代谢、排泄(ADME)、毒性以及药理活性产生重大影响的属性。亲脂性作为一种重要的药物分子属性,已经有几十年的研究和应用历史,它能被快速测量或准确计算。亲脂性还和其他许多性质相关,如溶解度、渗透性、代谢、毒性、蛋白结合和分布。


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亲脂性的基本原理

亲脂性是化合物优先在非极性脂介质中分配,而不在水相中分配的一种趋势。它对药物的其他属性具有重要的决定作用。

亲脂性评估的一个传统方法,是看化合物在互不混溶的非极性和极性液体中的两相分配情况。一般情况下,用辛醇作为非极性相,而用缓冲水溶液作为极性相。测得的分配值用Log P和Log D来表示。

·LogP与LogD的区别

Log P: 在化合物的所有分子均以中性形式存在的 pH条件下,其在一种有机相(例如辛醇)和一种水相(例如缓冲液)中分配系数的对数即为 Log P。

Log P=Log([化合物有机相]/[化合物水相])

Log D:某一特定的pH(x)下,化合物部分以离子形式存在,部分以中性分子形式存在;此pH下的化合物在一种有机相(例如辛醇)和一种水相(例如缓冲液)中分配系数的对数即为 Log D。

Log DpHx=Log([化合物有机相]/[化合物水相])

Log P值取决于中性分子在两相中的分配情况,而Log D值取决于以中性形式存在的分子分配情况,加上以离子形式存在的分子分配情况。离子与极性水相的亲合力比与非极性有机相的亲合力更大。离子化的分子比例取决于水溶液的pH、化合物的 pKa,以及化合物是酸还是碱。对于酸性化合物,其在溶液中的中性分子和阴离子的比值随着 pH的增加而减小,因此,Log D也随着 pH的增加而减小。相反,对于碱性化合物,其在溶液中的中性分子和阳离子的比值随着 pH的增加而增加。因此,Log D也随着 pH的增加而增加。

Abraham[2.3]等人报道,Log P受化合物的几种基本属性所影响:

  • 分子体积

  • 偶极矩

  • 氢键酸度

  • 氢键碱度

分子体积和分子量相关,也影响为溶解分子而形成的溶剂空腔的大小。偶极矩影响分子和溶剂的极性排列。氢键酸度与氢键供体有关,氢键碱度与氢键受体有关,它们影响化合物与溶剂之间的氢键形成。Abraham 等人深入研究了这些影响因素,导出了线性自由能方程,能够预测分配行为。研究者经常使用这种方式,来评价基于分配属性方法的预测准确性,并通过加入计算,增强测定方法的预测能力,以获得更好的特殊性质模型[4]

应记住,亲脂性的改变与两相的下列条件有关∶

  • 分配溶剂/相

  • pH

  • 离子强度

  • 缓冲剂

  • 共存溶质或共存溶剂

例如,在辛醇和水中的分配不同于在环己烷和水中的分配。这是由于化合物在不同相中具有不同的分子属性,从而导致了溶剂和溶质分子相互作用的不同。前面已经讨论过,pH会影响离子化程度。离子强度的增加会导致水相极性的增加。缓冲剂也会影响极性、分子间相互作用,并且会作为反离子与药物分子原位成盐。共存溶剂,如二甲基亚砜(DMSO),可以与溶质相互作用,从而改变它们的分配行为,甚至在其相对百分比很低的情况也能有此效果。因此,在预测亲脂性的影响以及报告测定数据时,应考虑溶解条件的影响。

虽然一个亲脂性实验初看起来比较简单,但应该牢记实验条件对亲脂性的影响。当报道亲脂性数据时,下列条件应当被仔细控制和列出∶分配溶剂、 pH、离子强度、温度、缓冲盐组成、共存溶质、共存溶剂和平衡时间。在不同的条件下获得的亲脂性数据可能区别很大。
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亲脂性的影响

许多影响 ADME/Tox的药物性质模型都与亲脂性相关[5,6],包括渗透、吸收、分布、血浆蛋白结合、代谢、消除和毒性。Lombardo等人还发现亲脂性与药动学分布容积(Va)相关[5,6]

表1用于估计药物发现中 Log D7.4对类药性的影响[7]

表1 Log D7.4对类药性的影响

成药性相关小知识(1):亲脂性——logP、logD 第1张

        Log D7.4<1化合物的被动扩散渗透低,溶解度高,但吸收和脑通透性差。这类化合物由于极性较大,具有很高的肾清除。如果同时分子量低,可能会出现细胞旁路渗透。

1<Log D7.4<3这是一个理想的范围。由于溶解和被动扩散渗透间有良好的平衡,这类化合物通常具有良好的小肠吸收。由于代谢酶结合较低,使代谢最少。

3<Log D7.4<5由于较差的溶解性,这类化合物渗透性良好,但吸收程度低。在此范围内与代谢酶结合增加,使代谢程度高。

Log D7.4>5低溶解度导致这个范围内的化合物吸收和生物利用度都较差。因为与代谢酶亲合力高,导致代谢清除率高。因为化合物都蓄积在组织里,所以Vd和半衰期很高。



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亲脂性案例研究及结构修饰


亲脂性是一种基本的结构属性,可以影响高层次的理化和生化性质。对于通过结构修饰改善先导物系列性质,它常常可以提供有效的指导。在接下来的关于性质的大部分章节中,我们将讨论亲脂性对特定性质和结构修饰策略的影响。

△Log P被用来预测化合物在血脑屏障(BBB)的通透性[8]。△Log P是辛醇和水相分配的Log P减去环己烷和水相分配的 Log P。其差值主要来源于氢键对 Log POW(辛醇/水)和Log PCW(环己烷/水)贡献的差异。当 △Log P增加时,血脑屏障渗透性通常降低。该值与血脑屏障渗透之间的相关性,可以解释为氢键对血脑屏障渗透性的负面影响。

亲脂性也被认为与活性相关。图2 以11 个具有抗惊厥活性的系列化合物为例[9],显示了这种相关性。Log P与-Log ED相关(R2=0.83)。因此,活性会随着 Log P的增加(ED 减小)而提高。

成药性相关小知识(1):亲脂性——logP、logD 第2张

图2 抗惊厥活性与 Log P之间的关系。在这一系列化合物中,活性随 Log P 增加而提高。



参考文献

[1]Determination of solute lipophilicity.as log P(octanol) and log P(alkane)using poly(styrene-divinylbenzene) and immobilized artificial membrane stationary phases in reversed-phase high-performance liquid chromato- graphy. Journal of Chromatography. A.766,35-47.

[2]Connection between chromatographic data and biological data. Journal of Chromamgraphy. B. Biomedical Sciences and Applicaions, 745,103-115.

[3]High throughput lipophilicity determination: Comparison with measured and calculated log P/log D values.In B.Testa,H. van de Water- beemd, G.Folkers. & R.Guy (Eds.).Pharmacokinetic wptimiation in drug research: Biologicalphysiological. and computational srategies. Zurich: Verlag Helvetica Chimica Acta, pp. 127-182.

[4]QSAR and ADME.Bioorganic& MedicinalChemistry. 12. 3391-3400.

[5]Prediction of volume of distribution values in humans for ncutral and basic drugs using physicochemical measurements and plasma protein binding data. Journal of Medicinal Chemisry. 45, 2867-2876.

[6]High throughput measurement of logD and pKa.In P.Artursson,H. Lennernas.& H. van de Waterbeemd (Eds.).Methods and principles in medicinal chemisry 18(pp.21-45). Weinheim:Wiley-VCH.

[7]Development of a new physicochemical model for brain penetration and its application to the design of centrally acting H2 receptor histamine antagonists.Journal of Medicinal Chemistry,31,656-671.

[8]Anticonvulsant activity of phenylmethylene-hydantoins: A structure-activity relationship study. Journal of Medicinal Chemisry,47,1527-1535.

[9] SAR QSAR Environ Res. 2010 Jan 1;21(1):127-48.

[10] 类药性质:概念、结构设计与方法 从ADME到安全性优化,2008,钟大放等译.

[11] DrugLike Properties: Concepts, Structure Design and Methods from ADME to Toxicity Optimization. Second Edition,2016.Li Di and Edward H. Kernsn.


标签: 成药

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