“告别手工绘制chemdraw分子”——自动识别分子结构工具Collector

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“告别手工绘制chemdraw分子”——自动识别分子结构工具Collector  第1张

ChemDraw凭借强大的绘图功能已成为化学人首选结构绘制软件,然而人类的本质是“懒惰”,每天处理一大堆的瓶子、柱子、图谱已经是个大工程了,如果在画图和科研的过程中能有一点点的“方便”可以大大的提高工作效率那真是一件幸事!前几天看到了同学推荐给我的这款极速提取化学结构软件【StoneMIND Collector】(下文简称Collector),在深度使用两周之后,感觉Collector真的是太好用了,而且还免费!!不敢独享,特分享给大家。

推荐等级:★ ★ ★ ★ ★

推荐等级:★ ★ ★ ★ ★


 

“告别手工绘制chemdraw分子”——自动识别分子结构工具Collector  第2张


望石の初印象


● 使用方便+高准确度识别各类化学结构




 

“告别手工绘制chemdraw分子”——自动识别分子结构工具Collector  第3张

软件下载地址:

https://stonewise.cn/mol_product?channel=8

(复制该链接至PC浏览器打开,点击客户端下载即可获取产品Windows & MacOS版本安装包)


望石の初印象


使用方便+高准确度识别各类化学结构


选中任意文件中的化学结构后截图,短短1-3秒就可以识别成计算机可编辑格式的结构文件。识别准确度很不错,给出清晰漂亮的化学结构,节省绘制时间,超赞~


“告别手工绘制chemdraw分子”——自动识别分子结构工具Collector  第4张


● 收藏识别后结构获取分子信息预测结果

基于AI的算法模型及各类知识规则预测一系类分子的性质例如结构性质(类药性/可合成性/分子量/氢键受体及供体数目/PSA/芳香环数目)、理化性质(溶解度/LogP)、DMPK性质(Caco-2肠渗透性/生物利用度/血浆蛋白结合率/血脑屏障穿透率/PGP底物/CYP450抑制剂)、毒性(h-ERG-心脏毒性)。在软件里将识别的分子点击收藏后再点击收藏夹跳转网页版即可查看该分子的所有预测性质。这些信息的反馈,对于药学领域研究人员来说,极为珍贵!对于结构的理解,帮助极大!再赞~


“告别手工绘制chemdraw分子”——自动识别分子结构工具Collector  第5张


识别后结构格式兼容ChemDraw及其他画图和CADD软件

很多人习惯了ChemDraw里画结构和进行各种基团部位的修饰,Collector也能一键复制smiles或者mol直接在ChemDraw里打开。支持下载为sdf文件格式,可在ChemDraw/InDraw/KingDraw专业画图软件及各类CADD软件中打开查看和进一步编辑。

“告别手工绘制chemdraw分子”——自动识别分子结构工具Collector  第6张


免费

再也不用到处找破解软件安装包了,这一点相当友好!赞赞赞~



望石の后印象


都说男女间谈恋爱是“始于颜值,陷于才华,忠于人品”,用这句话形容我对这款软件的使用感受也丝毫不差。从软件下载、安装到打开使用都非常丝滑,软件界面非常“清秀”,相比于部分科研软件的“严谨科技简洁”的界面风,Collector的界面UI设计很符合当下年轻人的审美。容易上手,使用方便。
在试过一些小分子后想给它找点难度,找了一篇课题组已发表的成果中分子式相对较多的文章(参考文献为ACS Catal. 2019, 9, 4054−4064),将专业方向中常用的木质素大分子结构作为选取对象,其结构是这样的↓

“告别手工绘制chemdraw分子”——自动识别分子结构工具Collector  第7张



选择这个结构进行识别的理由是:这个结构我们经常用到且画起来很费功夫,除此之外如纤维素和半纤维素与木质素结构相似,都是长链分子且出现频率很高。同时因为木质素的独特性,其中的苯环间的连接键是不同的,不是简单的画好一个结构单元再复制粘贴就能画好的,即使在ChemDraw里一不小心也会画错,在开始之前适当的降低了期待值,内心里是觉得识别不出来的,以下是识别结果↓


“告别手工绘制chemdraw分子”——自动识别分子结构工具Collector  第8张


左侧是我提取的化学结构,中间的是软件的提取结果,右侧是放在ChemDraw后的效果,我观察了一下,除了一个链接键有漏画以外,准确率在我看来超乎想象!而且结果是可编辑的,我试着编辑了一下,识别的错误可以修正,整体我很满意!非常便利!对我需要绘制化学或者生物大分子的科研工作者还是可以省去很多画图的时间。

除此之外还可以将这个分子结构收藏起来,需要用的时候直接调出来取用,对于我这样一个丢三落四的人,收藏夹的功能实在太友好了!

用着用着我点击收藏夹跳转到网页版,不仅可以查看我收藏分子的各种性质预测的结果,还能批量提取,一次可同时操作提取10篇pdf!几千个结构自动排队提取,这个不得不点个大赞~



望石の总印象

总结一下,以下是这款软件的主要功能~

✓ 结构美化支持一键美化结构。

✓ 名称转结构支持IUPAC名称转结构。

✓ 编辑校正:包含功能齐全的结构编辑器,支持识别后对化学结构的二次修改。

✓ 快捷截图:一键截图,随时随地截取化学结构;左右对照视图,方便识别后的化学结构对比操作。支持自定义快捷键截图识别化学结构。

✓ 收藏预测:支持将识别后的化学结构收藏起来,方便下次使用查看。识别后的结构点击收藏支持查看各类分子性质预测结果。

✓ 格式多样:支持复制成MOL和SMILES两种文件格式。支持下载为sdf文件格式,可支持在ChemDraw/Indraw/Kingdraw专业画图软件及各类CADD软件中打开查看。

✓ 缩写+模板丰富:支持1000种常见基团简写插入和直接识别成mol/sdf/smiles格式。丰富的绘图模板库,糖类,环类、碱基类、L型氨基酸等14种模板

  ✓ 网页版本支持批量提取:可上传任意pdf或者图片,后台自动提取(化学结构识别)和IUPAC(标准化学名称识别)提取结构,该网页版目前为免费Beta版本。

科研是枯燥的,科研也可以是快乐的。攻克难题是快乐的,完成很漂亮的论文图表就像亲手创造艺术品一样,也是成就感满满。希望这款软件可以成为你的科研利器,助你乘风破浪,疾驰远航!



温馨提示


1.在Collector客户端点击左侧导航栏图标,即可观看产品使用视频。
2.打开望石智慧官网www.stonewise.cn,点击产品介绍下的StoneMIND Collector, 有该产品的详细介绍和使用视频。
3.任何产品使用问题或建议可直接联系Collector微信客服,请扫下方二维码添加微信或工作日9:00-18:00拨打手机号15711471378(微信同号)。


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